苦荞NAC基因家族的生物信息学分析

作者:荣玉萍; 张文香; 邓娇; 石桃雄; 梁成刚; 汪燕; 张晓娜; 李洪有; 孟子烨; 黄娟*
来源:湖南农业大学学报(自然科学版), 2019, 45(03): 273-280.
DOI:10.13331/j.cnki.jhau.2019.03.010

摘要

以苦荞基因组数据库为基础,利用比对程序,经鉴定和筛选,共获得72个苦荞NAC家族基因的序列,对其进行生物信息学分析。基因结构分析表明,除FtPinG0002967400.01.T01基因外,苦荞NAC家族其余71个基因均含有内含子。蛋白质理化性质预测分析表明,72条蛋白序列具有NAC结构域。72个NAC基因共有7个保守基序,在苦荞8条染色体上均有分布。有33个NAC基因在种子发育过程中差异表达。系统进化分析表明,苦荞NAC蛋白序列与拟南芥的可以分为9个亚家族。

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