我国棉花黄萎病菌基于SSR的遗传多样性分析

作者：尹志新; 朱荷琴; 李志芳; 冯自力

来源：棉花学报, 2011, (04): 369-378.

• 棉花
• 大丽轮枝菌
• SSR
• 遗传多样性分析
• 非加权组平均法 cotton
• Verticillium dahliae
• genetic diversity analysis
• unweighted pair-group method with arithmetic means(UPGMA)

为了对棉花黄萎病菌群体的遗传多样性进行研究,以棉花黄萎病菌基因组DNA为模板,用双因素和单因素水平优化的方法对SSR反应体系的重要参数进行摸索和优化,建立了最适反应体系。从300对引物中筛选出13对多态性较高的引物,并对来自我国12个省96个县(市)的170个棉花黄萎病菌株进行SSR分析。SSR图谱的聚类分析结果将供试菌株划分为2个群体:群体Ⅰ有26个菌株,其中18个为新疆菌株,占69.23%;群体Ⅱ有144个菌株,其中138个为内地菌株,占95.83%。新疆菌株与其它省份的菌株存在明显差异,SSR指纹图谱与菌株地理来源存在显著的相关性,而与菌株致病力强弱没有表现出相关性,但弱致病力菌株可能更...

• 单位
  中国农业科学院棉花研究所; 棉花生物学国家重点实验室