甜菜M14品系BvM14-UNG基因克隆及生物信息学分析

作者：王盛昊; 于冰^*

来源：中国农学通报, 2022, 38(04): 16-22.

• 甜菜M14品系
• BvM14-UNG基因
• 碱基切除修复
• 基因克隆
• 生物信息学分析

为研究Bv-UNG蛋白在植物碱基切除修复(base-excision repair,BER)途径中的功能,以甜菜M14品系为材料,根据NCBI上二倍体栽培甜菜UDG编码基因Bv-UNG序列,利用同源序列克隆法获得甜菜M14品系BvM14-UNG基因cDNA全长,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该基因编码374个氨基酸,BvM14-UNG蛋白表现出较强的亲水性,为可溶性蛋白,主要由无规卷曲和α螺旋构成,具有水激活基序、尿嘧啶结合基序、小沟插入环基序、尿嘧啶糖基化酶抑制剂(uracil glycosylase inhibitor,UGI)结合位点和亮氨酸(Leu)位点,属于UDG-F1亚家族,BvM14-UNG蛋白与甜菜BvUNG蛋白亲缘性最近,其次为藜麦CqUNG蛋白。本研究可为后续开展甜菜M14品系BER途径中BvM14-UNG酶活性研究提供参考。

• 单位
  黑龙江大学; 生命科学学院