摘要
细胞分裂素脱氢酶(CKX)通过调控植物体内的细胞分裂素的水平来影响其生长发育过程。为探究苹果CKX家族基因的信息,本研究利用现代生物信息学分析,首次对苹果中CKX基因家族进行全基因组鉴定和分析。结果表明,在苹果全基因组中鉴定出11个CKX基因家族成员,不同成员的MDCKX蛋白理化性质和二级结构均存在一定差异,11个MDCKX蛋白定位在植物体的不同位置中,其中2个具有双向定位的特性;系统进化树将CKX基因家族分为3个亚家族,同一亚家族的成员基因结构和保守基序具有相似性,也有一些虽然亲缘关系较近,但其基因结构和保守基序模式差异较大;MDCKX家族成员含有4~6个外显子结构,共有10个保守基序;11个苹果CKX家族基因不均匀地分布在其中6条染色体中,在16号染色体中发现MDCKX10和MDCKX11一对串联重复基因,有6对基因之间存在共线性关系。该研究结果将为苹果CKX基因家族的功能和应用研究提供一定的理论依据。
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单位吕梁学院