基于VNTR标记的湖南省柑橘黄龙病菌遗传多样性分析

作者：钱磊; 王逸才; 周泽华; 邓杰夫; 雷玲; 易图永

来源：分子植物育种, 2022, 1-8.

• 柑橘黄龙病菌
• 多位点可变数目串联重复序列分析
• 遗传多样性
• 群体结构分析

为明确湖南省柑橘黄龙病菌（Candidatus Liberibacter）遗传多样性与地理区域的关系，本研究首先从湖南省柑橘（Citrus reticulata）主产区采集柑橘黄龙病疑似样本，利用PCR检测确定柑橘黄龙病菌阳性样本；基于6个可变数量串联重复分子标记（variable-number tandem-repeat， VNTR）对湖南省内不同地理来源的柑橘黄龙病菌进行多位点可变数目串联重复序列分析（multiple locus variable-number tandem repeat analysis， MLVA），利用贝叶斯算法对黄龙病菌的群体遗传结构进行分析。结果显示：从1 322份样本中筛选到86份合格阳性样本，6个VNTR位点多态性系数（H）分别为0.38、0.92、0.79、0.28、0.68和0.13；在所有样本中，1号VNTR位点重复7次的的样本占84.88%，4号VNTR位点重复5次的的样本占84.88%，6号VNTR位点重复3次的的样本占95.35%；合格样本中一共出现了64种基因型；通过非加权配对算术平均法（unweighted pair-group method with arithmetic means， UPGMA）聚类和Structure群体结构分析，发现所有样本均可分为三个类群，且永州和郴州的样本在各类群中均有分布，具有较高的遗传多样性。本研究为湖南省柑橘黄龙病防控阻截带的建立提供理论依据。

• 单位
  湖南农业大学