RNA结合蛋白对肝癌预后和免疫浸润的评估价值

作者:陈苗; 张家康; 李述捷; 易永祥*
来源:生物技术, 2023, 33(01): 111-110.
DOI:10.16519/j.cnki.1004-311x.2023.01.0017

摘要

[目的]探索RNA结合蛋白(RBP)在肝癌预后以及免疫浸润中的评估价值。[方法]下载TCGA数据库中肝癌(LIHC)数据,筛选出差异表达的RBP基因。利用LASSO和多因素COX构建风险模型,Kaplan-Meier方法比较高低风险组患者的预后。对高低风险组患者的差异基因进行功能富集分析。利用GSVA分析高低风险组免疫浸润,并比较两组患者药物敏感性和免疫治疗反应性。[结果]总共得到330个差异基因,LASSO-COX回归模型最终纳入6个基因(UPF3B、MRPL54、ZC3H13、DHX58、PPARGC1A、EIF2AK4)。高风险组患者总体生存率劣于低风险组患者(P<0.05)。风险模型预测患者总体生存率的AUROC在TCGA和ICGC中分别为0.756和0.781。免疫浸润分析提示高风险组调节T细胞富集量高于低风险组,而NK细胞则较低。两组患者对索拉非尼、多西他赛、顺铂敏感性有明显差异(P<0.05),且低风险组对免疫治疗更敏感。[结论] RBP风险模型可有效评估肝癌患者的预后、免疫浸润状态、化疗药物及免疫治疗的敏感性,可能为肝癌患者的风险分级和免疫治疗带来新的思路。

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