基于转录组测序探究TGF-β对成纤维细胞作用的机制研究

作者：王想; 方波; 袁昊; 米俊豪; 谢毓丽; 莫泳锋; 杨日荣^*

来源：右江民族医学院学报, 2023, 45(02): 224-229.

• 成纤维细胞
• 转化生长因子β
• 转录组测序
• 膀胱肿瘤

目的 基于转录组RNA测序筛选转化生长因子β(transforming growth factor-beta, TGF-β)刺激的成纤维细胞与正常成纤维细胞的差异mRNA。方法 对正常人成纤维MRC-5细胞和经20 ng/mL TGF-β刺激24 h后的MRC-5细胞进行转录组RNA测序，筛选出两组之间的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行生物信息学分析，包括基因功能(GO)、京都基因百科全书(KEGG)富集分析、蛋白质相互作用网络分析(PPI)以及相关基因对肿瘤生存预后的影响。结果 筛选出在33 692个基因中差异表达的mRNAs共161个，其中上调39个，下调122个；GO分析表明，DEGs主要富集的生物学过程包括核苷酸生物合成、代谢和神经元凋亡、坏死等过程；KEGG通路富集发现这些信号主要涉及核苷酸生物合成过程，核苷磷酸代谢过程，神经元凋亡等过程，其中核苷酸生物合成在6条信号通路中均被富集到；利用TCGA数据库对膀胱癌(BLCA)进行生存分析发现TGFB1I1、HYOU1和CAT基因同时高表达时，与患者较差预后显著相关。结论 mRNA在TGF-β刺激后的成纤维细胞和正常成纤维细胞中存在表达差异，筛选出在BLCA病人中表达的TGFB1I1、HYOU1和CAT,有望作为患者的预后标志物。

• 单位
  广西医科大学; 基础医学院