基于SRAP标记的哈尼梯田红米遗传多样性及群体结构分析

作者：马孟莉; 周晓梅; 郑云; 张婷婷; 张晓倩; 卢丙越^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(07): 2231-2237.

DOI：10.13271/j.mpb.017.002231

• 哈尼梯田
• 红米
• 遗传多样性
• 群体结构

著名的哈尼梯田核心区位于云南省元阳县,至今仍以种植水稻地方品种为主,梯田红米是其中的主要类型。本研究利用筛选的20对SRAP标记分析60份哈尼梯田红米品种的遗传多样性和群体结构。20对SRAP标记共扩增出182个条带,其中165个具有多态性,多态性比率达90.66%,平均每对引物可扩增9.10个条带;观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样度(H)和Shannon信息指数(I)分别为1.907、1.404、0.239和0.366,表明云南哈尼梯田水稻红米品种具有较丰富的遗传多样性。聚类分析和主成分分析均将60份红米品种分为两大类,即57个籼稻品种聚为第一类,3个粳稻品种聚为第二类,表明哈尼梯田红米以籼稻为主,在籼稻亚群中有部分品种存在遗传分化现象,这一结果与STRUCTURE软件分析的群体结构类型一致。本研究为哈尼梯田红米资源的保护和利用提供了科学依据。

• 单位
  红河学院