DNA条形码技术在福建省鼠种鉴定中的应用

作者：刘维俊; 徐国英; 肖方震; 林代华; 刘菁; 韩腾伟

来源：中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(02): 175-179.

• DNA条形码
• 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因
• 鼠种鉴定
• 福建省

目的以福建省常见鼠种为研究对象,探讨DNA条形码技术应用于鼠种鉴定的可行性。方法 2017-2018年采用笼日法获得福建省部分地区的5属11种共77只鼠类标本,经核酸提取、聚合酶链式反应(PCR)及序列测定获得线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因片段序列,通过同源性比对、遗传距离分析和系统进化树构建鉴定鼠种,并与经典形态学鉴定结果比较。结果所有标本均可通过PCR扩增出特异性COⅠ基因片段条带,并且均在GenBank数据库中匹配到相对应的已知鼠种,且同源性均在97.88%及以上;标本种间平均遗传距离为15.31%,种内平均遗传距离为0.21%,种间遗传距离明显高于种内遗传距离;系统进化树分析显示,同种鼠种均聚于同一分支上,且置信度高。77只鼠类标本中,有3只鉴定结果有差异,经形态学再鉴定,发现现场鉴定结果有误。结论 DNA条形码技术可作为形态学鉴定的补充,可应用于福建省常见鼠种鉴定工作中。

• 单位
  福建省疾病预防控制中心