羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及B细胞和T细胞抗原表位预测

作者：李刚; 龙琴琴; 吴鹏; 曾月娥; 庞峰^*

来源：贵州畜牧兽医, 2023, 47(05): 45-48.

• 羊口疮病毒
• ORFV113蛋白
• 蛋白特性
• B细胞抗原表位
• T细胞抗原表位

为了预测羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及其优势B细胞和T细胞抗原表位，分别利用在线软件ProtParam预测ORFV113蛋白的理化性质，DeepTMHMM预测其跨膜区，SignalP 6.0预测其信号肽，SOPMA预测其二级结构，PSORT预测其亚细胞定位，ABCpred预测其优势B细胞表位，IEDB预测其优势细胞毒性T细胞表位。结果：ORFV113蛋白由208个氨基酸组成，为不稳定亲水性蛋白，分子质量约22.08 ku,理论等电点(PI)为4.36,在3～25 aa处存在1个跨膜区，不含信号肽，主要定位于细胞质膜；ORFV113蛋白的二级结构由延伸链(16.35%)、α-螺旋(23.08%)、β-转角(4.81%)、无规则卷曲(55.77%)组成；ORFV113蛋白存在11个优势B细胞表位，分别位于164～179 aa、62～77 aa、132～147 aa、120～135 aa、138～153 aa、101～116 aa、56～71 aa、188～203 aa、175～190 aa、49～64 aa、108～123 aa;存在3个优势T细胞表位，分别位于63～71 aa、121～129 aa、162～170 aa。结论：ORFV113蛋白为亲水性的跨膜蛋白，含有多个优势B细胞和T细胞抗原表位，可作为多表位疫苗的靶点。

• 单位
  动物科学学院; 贵州大学