基于线粒体Cytb序列的伯氏肩孔南极鱼群体遗传结构初步分析

作者：赵娜; 马春艳; 宋炜; 冯春雷; 王鲁民; 张凤英; 蒋科技; 赵宪勇; 马凌波^*

来源：海洋渔业, 2019, 41(01): 16-24.

DOI：10.13233/j.cnki.mar.fish.2019.01.003

• 伯氏肩孔南极鱼
• Cytb
• 遗传结构
• 遗传多样性

选择线粒体Cytb序列为遗传标记分析了伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性、遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体Cytb序列中共检测到27种单倍型。与其它分布于南大洋的鱼类相比,伯氏肩孔南极鱼有着相似的遗传多样性特征,即较高的单倍型多样性(haplotype diversity,h=0. 685 90±0. 002 36)和较低的核苷酸多样性(nucleotide diversity,Pi=0. 002 59±0. 013 43)。伯氏肩孔南极鱼种群间的平均遗传距离为0. 39%,分子变异分析(AMOVA)结果显示,组群间的变异为4. 42%(P <0. 05),群体内的为95. 58%(P <0. 05),基于单倍型构建的进化树的结果均表明伯氏肩孔南极鱼群体不具有明显的地理谱系结构。中性进化分析表明伯氏肩孔南极鱼群体在10万年前(大约中更新世时期)经历过快速扩张时期。分子方差分析和Fst表明伯氏肩孔南极鱼的遗传变异主要来自种群内的个体之间,极少数遗传变异来自于群体之间。研究结果显示南极地区的伯氏肩孔南极鱼5个采样点之间具有一定的基因交流,是一个随机交配的群体。

• 单位
  中国水产科学研究院黄海水产研究所; 中国水产科学研究院东海水产研究所; 上海海洋大学