辣椒CaArcA基因的电子克隆与生物信息学分析

作者：罗火林; 熊冬金; 罗丽萍; 杨柏云

来源：生物技术, 2013, 23(06): 17-21.

• 辣椒
• G蛋白β亚基
• 电子克隆
• 生物信息学

目的:获得辣椒(Capsicum annuum)G蛋白β亚基基因(CaArcA)序列。方法:以拟南芥同源序列为探针,利用电子克隆技术获得了CaArcA基因的cDNA全长,采用生物信息学方法,对该基因所编码的蛋白从理化性质、分子进化、高级结构等多角度进行分析。结果:该基因cDNA全长1 173 bp,其开放阅读框为993 bp,编码330个氨基酸,分子量为36.1 kDa;具有23个磷酸化位点,无信号肽和跨膜区域,定位在细胞膜外。通过同源比对发现,CaArcA蛋白与与拟南芥(Arabidopsis thaliana)的同源蛋白相似性在80%以上。结论:利用电子克隆的方法获得一个辣椒G蛋白β亚基基因的cDNA序列。

• 单位
  南昌大学生命科学与食品工程学院