摘要
目的 基于生物信息学分析Stanford A型主动脉夹层(AD)和高血压的共同差异表达基因(DEGs)。方法 本研究时间为2021年6月至2022年6月。在美国国家生物技术信息中心的基因表达综合数据库(GEO)筛选出GSE52093数据集和GSE76845数据集,采用在线编辑工具GEO2R筛选GSE52093数据集和GSE76845数据集的DEGs,绘制韦恩图以分析GSE52093数据集和GSE76845数据集的共同DEGs。利用在线数据库DAVID对GSE52093数据集、GSE76845数据集的DEGs及二者共同DEGs进行GO功能富集分析,利用在线数据库KOBAS 3.0对GSE52093数据集和GSE76845数据集的共同DEGs进行KEGG通路富集分析。将GSE52093数据集和GSE76845数据集的共同DEGs的蛋白质相互作用网络图导入Cytoscape软件,并根据最大领域组件密度(DMNC)、边缘渗透组件(EPC)、最大集团中心度(MCC)、应力、度五种拓扑分析方法筛选Hub基因,然后通过韦恩图筛选五种拓扑分析结果的共同Hub基因。结果韦恩图分析结果显示,GSE52093数据集与GSE76845数据集的共同DEGs有16个,其中共同上调DEGs 8个,共同下调DEGs 8个。GO功能富集分析结果显示,GSE52093数据集和GSE76845数据集的共同DEGs主要富集在骨化、细胞分化的负调控、激素调节和细胞周期的负调控。KEGG通路富集分析结果显示,GSE52093数据集和GSE76845数据集的共同DEGs主要富集在叶酸-一碳单位循环、叶酸代谢、嘧啶代谢、胆固醇代谢和Hippo通路。韦恩图筛选出7个共同Hub基因,分别是MAD2L1、TYMS、SPP1、ACTG2、MARK1、LATS2、CASQ2,其中MAD2L1、TYMS、SPP1为下调Hub基因,ACTG2、MARK1、LATS2、CASQ2为上调Hub基因。结论 本研究共筛选出7个Stanford A型AD和高血压的共同Hub基因,分别是MAD2L1、TYMS、SPP1、ACTG2、MARK1、LATS2、CASQ2,其中上调的Hub基因ACTG2、MARK1、LATS2、CASQ2可能成为AD伴高血压患者的生物学预测因子和潜在药物作用靶点。
-
单位苏州大学; 苏州大学附属第一医院