中国栽培大豆群体结构不同分类方法的比较

作者：魏世平; 刘晓芬; 杨胜先; 吕海燕; 牛远; 章元明

来源：南京农业大学学报, 2011, (02): 13-17.

• 群体结构
• 遗传多样性
• STRUCTURE软件
• 聚类分析
• 大豆 population structure
• genetic diversity
• STRUCTUR software
• cluster analysis
• soybean

利用215个大豆品种的135个分子标记数据,用STRUCTURE软件、PowerMarker软件和地理生态类型3种分类方法研究了大豆品种的群体遗传结构,以探索适宜的分类方法。结果表明:用STRUCTURE软件分类时,亚群间成对分化系数(Fst)的平均值最大,为0.108 3,含有相同最高频率等位基因的位点数最小,为85,说明各亚群间遗传差异最大;亚群内遗传多样度(Hs)为0.491,多态性信息含量(PIC)为0.737 6,群体内分化系数(Fis)为0.974,均为最小,说明亚群内个体间遗传相似性最高。因此,用STRUCTURE软件研究群体遗传结构最适宜。

• 单位
  南京农业大学; 作物遗传与种质创新国家重点实验室