摘要

内质网应激(ERS)是影响癌症发生发展的重要因素之一。本研究的目的在于通过生物信息学方法探讨内质网应激基因在胃癌(STAD)中的表达及预测预后的价值。从癌症基因组图谱数据库(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)获取STAD样本,“ConsensusClusterPlus”R包用于识别胃癌内质网应激相关分子亚型(C1、C2),Kaplan-Meier分析比较分型间生存差异,并进行基于GEO队列的外部验证。基因本体论(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析比较其差异基因富集通路差异。使用“limma”R包识别分型间差异基因,通过LASSO回归分析构建预后模型,依照风险值中位数将TCGA训练集分为两组,评估免疫细胞浸润显著差异。生存分析显示,C1的生存结局较C2更好。差异分析确定了6个与分型相关的内质网应激基因,GO富集和KEGG通路分析揭示了亚型间差异基因参与了多种细胞和生物学功能。通过LASSO回归分析构建了一个8基因预后模型,Kaplan-Meier分析表明高风险组患者较低风险组生存时间短,ROC分析验证了预测模型在STAD预后预测中的准确性,免疫分析揭示了两组之间免疫细胞浸润差异显著。本研究基于内质网应激基因对STAD患者进行分型,并构建了新的预后模型,具有预测STAD患者预后的作用,并可为个性化治疗提供一些参考。