赛鸽圆环病毒天津株全基因组的扩增和序列分析

作者：王志悦; 李欣蕊; 孙嘉咛; 王许刚; 王瑞; 李春红; **举; 张瑞华; 徐彤

来源：中国动物传染病学报, 2022, 1-6.

DOI：10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.20220302.001

• 鸽圆环病毒
• 序列分析
• 重组分析

本研究利用PCR从有腹泻症状的鸽中检测到圆环病毒，进一步进行了全基因组扩增。基因组序列分析表明该基因组长度为2032bp，编码5个开放阅读框（ORFs），5'端和3'端各存在一个基因间隔区。该基因组序列与已登录的中国、澳大利亚、日本、波兰、比利时和巴西的PiCV基因序列同源性为81.5%-97.7%。全基因组系统发育分析显示，54个序列（53个参考PiCV基因组序列和1个本研究PiCV基因组序列）可分为6个分支（A，B，C，D，E和F），本研究分离毒株位于B支，与来自比利时（DQ915957和DQ915958）、中国（KX108826，KX108805，KX108825，KJ704802和KJ704806）的分离株亲缘关系密切。Simplot重组分析结果显示Rep ORFs包含多个重组热点，表明我国鸽圆环病毒存在遗传多样性。

• 单位
  河北北方学院