天仙藤全长转录组测序及分析

作者：黄素华; 韦范; 全昌乾; 唐美琼; 胡营; 韦筱媚; 朱艳霞; 韦坤华; 黄媛; 汤丹峰^*; 缪剑华^*

来源：中国现代中药, 2023, 25(07): 1473-1485.

DOI：10.13313/j.issn.1673-4890.20221115001

• 天仙藤
• 全长转录组
• 测序分析
• 功能注释

目的：获得天仙藤全长转录组数据库，挖掘天仙藤功能基因。方法：采用PacBio SequeⅠ高通量测序系统，对天仙藤的茎、叶、果3个部位的混合样品进行全长转录组测序及分析。结果：共获得176 354条环形一致性序列（CCS），获得184 439个高质量isoforms，并注释了139 826个isoforms，检测出3058个转录因子和135 527个简单序列重复（SSR）位点，还预测到76 862个长链非编码RNA (lncRNA)和36 204个mRNAs。结论：获得了较可靠的天仙藤全长转录组数据，可为深入研究天仙藤基因组、生物学特性、相关代谢途径、信号通路及其分子机制提供数据支持。

• 单位
  广西医科大学; 广西科技大学; 广西壮族自治区药用植物园