m6A修饰的LncRNA对宫颈癌预后及免疫治疗反应评估的价值

作者：郭依琳; 林钰博; 白洋洋; 赵虎; 王武亮^*

来源：郑州大学学报(医学版), 2022, 57(06): 773-779.

DOI：10.13705/j.issn.1671-6825.2022.04.036

• N6-甲基腺嘌呤
• 长链非编码RNA
• 宫颈癌
• 预后评估
• 免疫治疗

目的:研究N6-甲基腺嘌呤(m6A)相关的长链非编码RNA(m6A-LncRNA)对宫颈癌预后和免疫治疗反应评估的价值。方法:通过TCGA数据库下载304例宫颈癌病例的转录组数据及临床资料。选择25个m6A调节因子，通过Pearson相关分析和Cox回归鉴别宫颈癌预后相关m6A-LncRNA,再利用Cox回归建立基于m6A-LncRNA的宫颈癌预后风险评分，风险评分=∑LncRNAi的回归系数×LncRNAi表达量。利用Cox回归建立基于风险评分的宫颈癌预后预测模型并绘制列线图。通过C指数、ROC曲线和校准曲线评估列线图的判别和校准能力。利用CIBERSORT反卷积算法分析22种肿瘤浸润免疫细胞丰度和免疫表观评分(IPS)。结果:所构建的风险评分包括11个m6A-LncRNA(FAM198B-AS1、AC233728.1、AL021707.6、AC131159.1、DDX11-AS1、AC099850.4、DDN-AS1、U62317.4、LINC02802、AC015922.2、EP300-AS1)。利用风险评分与临床分期构建了宫颈癌预后预测模型。在建模数据集(n=266)和验证集(n=181)中，该模型1、3和5 a生存预测的ROC曲线下面积均大于0.7(P<0.05),经Bootstrap方法内部验证(重复1 000次)后的C指数分别为0.753和0.755,校正曲线显示预测结果与实际结果相关性良好。以风险评分的中位数作为界值，将304例宫颈癌病例分为高风险和低风险组，低风险组富含CD8+T细胞、调节T细胞和未活化的肥大细胞，IPS评分更高。结论:m6A-LncRNA具有潜在的宫颈癌预后预测和免疫治疗反应评估价值。

• 单位
  河南省中医院; 桂林医学院; 郑州大学第二附属医院