山溪鲵属的水样环境DNA分析方法的建立

作者：马红英; 张晗; 邓捷; 赵虎; 孔飞; 姜维; 张红星; 王启军^*

来源：安徽农业大学学报, 2021, 48(05): 784-789.

DOI：10.13610/j.cnki.1672-352x.20211105.016

• 环境DNA
• 山溪鲵属
• 系统发育分析

通过优化建立一套符合山溪鲵属物种环境DNA(environmental DNA,e DNA)分析的操作方法,为后期山溪鲵属资源调查及保护提供理论依据。以太白山溪鲵为研究对象,在室内养殖条件下,进行水样过滤及目标物种线粒体细胞色素b(Cytb)基因的扩增,根据测序序列构建系统发育树,来判定水样DNA中目标物种的归属。结果表明:(1)通过酒精直接浸泡、锡箔纸包裹、唾液收集管收集这3种方法对过滤养殖水后的滤膜进行贮存,发现酒精直接浸泡法可增加后期e DNA的提取量;(2)在进行目的片段的PCR扩增时发现高保真Mix的扩增成功率大于普通Mix;(3)应用属间特异引物进行不同物种扩增后,可通过系统发育分析来确定种间的分类。通过优化首次建立了山溪鲵属物种的水样e DNA分析方法,可为后期生活在相同水质且种间分化较小的物种进行e DNA分析提供参考。

• 单位
  陕西省动物研究所