溃疡性结肠炎相关性结肠癌与偶发性结直肠癌的差异基因分析

作者：郭跃; 王少波; 曾昊; 庞志刚^*

来源：中国现代医药杂志, 2022, 24(05): 10-14.

• 生物信息学
• GEO
• 溃疡性结肠炎相关性结肠癌
• 中枢基因

目的 基于GEO数据库查找溃疡性结肠炎相关性结肠癌与偶发性结直肠癌的数据集，得到差异基因，分析其对预后的影响，为肿瘤的个体化治疗寻求方法。方法 通过GEO数据库下载两种类型肿瘤数据集，然后导入R 4.0.3软件，获得表达矩阵，分析差异基因，并进行GO和KEGG分析，采用STRING数据库和Cytoscape软件分析蛋白质相互作用，识别中枢基因。GEPIA网站验证中枢基因是否具有表达差异以及对预后的影响。结果 溃疡性结肠炎相关性结肠癌和偶发性结直肠癌共筛选出上调基因396个，下调基因141个。蛋白质相互作用网络中筛选出10个关联度较高的中枢基因，其中CCL4、CCL2、IL1B、ITGAM基因的表达与预后有关。结论 溃疡性结肠炎相关性结肠癌与偶发性结直肠癌差异基因中CCL4、CCL2、ITGAM对预后影响明显，IL1B基因的表达与预后相关。

• 单位
  郑州大学第二附属医院