近年来,为了为人们提供更为优质的医疗卫生服务,国家加大了在医疗卫生体系建设方面的投入,各个医院的内部控制环境发生了明显的变化。新时期如果医院要保持稳定健康发展,必须要以医院的发展现状出发,改变内部控制的理念,通过新理念、新方法的应用,来提升医院的内部控制水平,推进医院财务会计的创新。基于此,本文重点探析了新时期医院财务会计内部控制存在的问题,并提出了相应的对策,对于推进医院的现代化发展有着重要的意义。