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摘要
为揭示辣椒基因组密码子偏性形成的影响因素，了解密码子偏性对基因表达的影响，以辣椒基因组和转录组数据为研究内容，利用CodonW和EMBOSS等软件对基因组密码子使用偏性进行分析。分析结果显示，辣椒编码基因平均GC含量为42.27%,偏好A/T作为密码子的第3位核苷酸，基因平均ENC值偏大；GC3与GC12相关性较弱，大部分基因远离ENC-plot曲线，近50%的基因ENC比值分布在GC3s的0.05～0.15组中；发现21个最优密码子，均以T、A或G结尾，大部分最优密码子在组织器官表达数据中得到验证。表明辣椒基因密码子使用偏性较低，除碱基突变外，较多地受到物种进化和人工选择等因素的影响。研究结果可为辣椒的分子进化和遗传育种研究提供理论依据。
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