基于miRNA相对表达量自动判别月经血和外周血

作者：王国力; 刘扬; 何红霞; 季安全; 张伟; 曹洋^*; 孙启凡^*

来源：刑事技术, 2021, 46(06): 566-572.

DOI：10.16467/j.1008-3650.2021.0029

• 法医遗传学
• 微RNA
• 外周血
• 月经血
• 自动化判别软件

目的探索有效区分月经血和外周血的mi RNA最优标记组合及最佳分类模型,并构建简便快速的自动化判别软件。方法对10种miRNA(miR-451a、miR-205-5p、miR-203a-3p、miR-214-3p、miR-144-3p、miR-144-5p、miR-654-5p、miR-888-5p、miR-891a-5p、mi R-124-3p)在200余份月经血和外周血样本中的相对表达量以实时荧光定量PCR检测,并以7种算法模型(核密度估计、K-最近邻、逻辑回归、线性判别分析、支持向量机、神经网络、随机森林)进行数据分析,选出鉴别效果最好的标记组合及算法模型,进而构建自动判别软件。结果月经血和外周血中差别最大的三种miRNA为mi R-205-5p、miR-203a-3p和miR-214-3p,使用miR-144-5p与上述miRNA中的一种或两种组合可达较好区分效果,其中基于miR-144-5p、miR-203a-3p和miR-205-5p所形成的"最优特征项组合一"稳健性最强。7种算法模型中最佳分类模型为核密度估计模型,其次为逻辑回归模型。结论本研究建立的自动判别软件界面友好、使用简单,适合辅助法医检验关于月经血和/或外周血判别分析的计算,便利于法医物证工作,有较大的推广应用价值。

• 单位
  生命科学学院; 中国政法大学; 生物资源与生态环境教育部重点实验室; 四川大学; 公安部物证鉴定中心; 山东大学(威海)