芹菜AgBOBBER基因的克隆及生物信息学分析

作者：赵倩; 朱顺华; 钟秀来; 陈志峰; 孟平红; 谭国飞

来源：分子植物育种, 2022, 1-19.

• 芹菜
• AgBOBBER
• 基因克隆
• 生物分析
• 基因表达

BOBBER基因是调控子叶形成的关键基因之一，芹菜种子为需光性种子，为了研究芹菜种子在不同光质下的发芽效果，以‘六合黄心芹’为试验材料，克隆获得芹菜AgBOBBER基因(GenBank: OM255388)，并进行生物信息学和不同光质下基因表达等分析。结果表明，‘六合黄心芹’在红/蓝光(R:B=1:1)下种子发芽效果最好，发芽整齐且苗壮。芹菜AgBOBBER基因全长891 bp，编码氨基酸296 aa，亲水性氨基酸的比例高于疏水性氨基酸。该蛋白质的相对分子质量和等电点分别为70.67 kDa和4.91。蛋白结构预测显示，该蛋白质的三级结构主要由β-折叠和无规则卷曲组成。进化树分析表明，芹菜与同属于伞形科的芫荽和白芷的进化关系最近，且伞形科与藜科的进化关系较近。荧光定量PCR结果显示，AgBOBBER基因在红/蓝光(R:B=1:1)下的表达量最高，在荧光灯下的表达量最低。本研究结果为全面提高芹菜种子的萌发率及芹菜幼苗的一致性提供参考。

• 单位
  生命科学学院; 贵州省农业科学院; 贵州大学; 遵义师范学院