核盘菌子囊盘cDNA文库的构建、EST序列分析与SsMADS基因的筛选

作者：刘金亮; 郭艳梅; 郑明; 张世宏; 潘洪玉

来源：吉林大学学报(理学版), 2010, (04): 694-698.

DOI：10.13413/j.cnki.jdxblxb.2010.04.031

• 核盘菌
• 子囊盘
• cDNA文库
• EST序列
• SsMADS基因 Sclerotinia sclerotiorum
• apothecium
• cDNA library
• expressed sequence tag(EST)
• SsMADS gene

以核盘菌子囊盘为材料,应用SMART(Switch Mechanism at 5′end of RNA Transcript)技术,构建了高质量的核盘菌cDNA文库.涂平板测定和酶切反应鉴定表明,原始文库的滴度为4.11×105,重组率达97.3%.通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析,共获得1800条核盘菌有效表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST).同源比对分析表明,844条独立基因代表了242个已知基因,其余602个EST为未知序列.这242个已知基因大致可以分为3类:78个可归属于生物学过程,97个可归属于分子功能,67个可归属于细胞组分.其中,在9...

• 单位
  吉林大学