基于COI基因的柴达盆地常见寄生蚤种的DNA条形码分析

作者：李海龙; 何建; 赵延梅; 杨汉青; 马英^*

来源：中国人兽共患病学报, 2018, 34(12): 1107-1111.

• COI基因
• 蚤
• DNA条形码技术
• 分子标记
• 物种鉴定
• 柴达木盆地

目的 COI基因对柴达木盆地部分蚤种进行分子生物学鉴定,旨在完善蚤类传统形态分类法的不足。方法PCR扩增68份蚤类标本的COI基因片段(约600bp)并进行测序和比对;用MEGA 6软件的K2-P双参数模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树。结果共测得柴达木盆地19种蚤的68条COI基因序列,种内遗传距离0.01%～2.9%,种间遗传距离3%～15.4%,种间遗传距离显著大于种内遗传距离。结论 NJ树显示同一物种形成高支持率的单系,种间分支很明显,表明COI可以作为DNA条形编码基因对柴达木盆地的常见蚤类进行物种鉴定。

• 单位
  青海省地方病预防控制所