基于16S rRNA序列分析糖皮质激素诱导大鼠骨质疏松模型肠道菌群的变化

作者：董万涛; 宋敏^*; 巩彦龙; 董平; 田杰祥; 张亚彬; 文浩楠

来源：中国骨质疏松杂志, 2020, 26(09): 1291-1339.

• 糖皮质激素
• 骨质疏松
• 肠道菌群
• 结构及功能
• 16S rRNA

目的通过16S rRNA序列分析探讨糖皮质激素诱导大鼠骨质疏松模型肠道菌群结构及功能的变化。方法将20只Wistar大鼠,随机分为模型组(K组,10只)正常组(MY组,10只),模型组采用糖皮质激素诱导法复制骨质疏松模型,正常组正常饲养,8周后每组随机选取4只收集大鼠粪便,提取并检测粪菌总DNA,检测样品质量,肠道菌群OTU分析、香农指数曲线分析、NMDS分析,16S rRNA扩增子测序,对标本中的细菌16S rRNA V3-V4进行定性分析、16S rRNA功能基因预测分析。结果经样品质量控制及甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测提示样品质量合格; K组与MY组共同含有575个OTU数据,K组和MY组分别有12个不同的OUT数据;当香农指数为3～4时,每个样本抽取的测序条数发现的物种趋于饱和; NMDS分析显示stress=0.05<0.2;与正常组比较,模型照组大鼠肠道菌群的多样性增加;功能主要以细胞运动、能量生产和转换、防御机制、转录、碳水化合物转运和代谢为主。结论糖皮质激素诱导大鼠骨质疏松模型肠道菌群在多样性、结构及功能方面发生了较大变化,肠道微生态细胞运动、能量生产和转换、防御、转录、碳水化合物转运和代谢等功能失衡可能为糖皮质激素诱发骨质疏松症的发病机制之一。

• 单位
  甘肃中医药大学; 甘肃中医药大学附属医院