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摘要
【目的】研究禁抗后饲粮中添加罗伊氏乳杆菌LR1对仔猪各肠段微小RNA（microRNA,miRNA）表达的影响，为罗伊氏乳杆菌LR1调控仔猪肠道功能的机制研究筛选潜在miRNA。【方法】选取21日龄体重相近的杜×长×大断奶仔猪144头，随机分为3组，每组8个重复，每个重复6头仔猪。对照组仔猪饲喂基础饲粮，抗生素组和益生菌组仔猪在饲喂基础饲粮的基础上分别添加复合抗生素（100 mg/kg喹乙醇+75 mg/kg金霉素）及5×1010 CFU罗伊氏乳杆菌LR1,试验期42 d。试验结束后每个重复随机屠宰1头仔猪，采集空肠组织进行miRNA高通量测序分析，采用实时荧光定量PCR检测筛选miRNA在仔猪十二指肠、空肠、回肠和结肠中的表达量。【结果】饲粮中添加罗伊氏乳杆菌LR1可引起仔猪肠道组织miRNA表达发生明显变化，改变了空肠高表达miRNA的排序。差异表达miRNA的潜在靶基因主要富集在代谢相关通路及PI3K-Akt、MAPK、Chemokine、Ras信号通路。实时荧光定量PCR显示，3个组间仔猪空肠差异miRNA的表达结果与转录组测序结果大致相同，其中，表达上调的miRNA在对照组和抗生素组间表达趋势较为一致，表达下调的miRNA在对照组和益生菌组间表达趋势较为一致，而肠道高表达miRNA在3个组中均有较为一致的表达趋势。【结论】禁抗后饲粮中添加罗伊氏乳杆菌LR1会引起肠道miRNA表达发生变化，筛选出的差异表达miRNA可为罗伊氏乳杆菌LR1调控仔猪肠道发育及营养吸收代谢等研究提供基础。
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