伽利略用望远镜观测到太阳黑子的存在以后,又对黑子的性质做了细致分析,排除了它们是行星凌日造成的现象,从多个方面论证了它们是太阳表面的一部分,并由此得出了太阳本身也存在自转的结论。伽利略的这一工作是科学史上首次对太阳黑子做出的具有真正科学意义的研究,其结论向传统的天体完美宇宙论发起了挑战,给教会统治的天文学说的理论基础以尖锐的抨击。