长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因3在胃癌组织的表达及临床意义

作者：张子龙; 熊斌^*; 庞典付; 张克难

来源：中华实验外科杂志, 2018, 35(03): 525-528.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1001-9030.2018.03.039

• 长链非编码RNA
• 胃癌
• 生物标志物

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)小核仁RNA宿主基因3(SNHG3)在胃癌组织的表达及其临床意义。方法利用癌症基因图集(TCGA)数据分析SNHG3在35例癌旁组织、56例Ⅰ期胃癌组织、123例Ⅱ期胃癌组织、169例Ⅲ期胃癌组织和41例Ⅳ期胃癌组织中的表达水平。利用Kaplan-Meier生存分析探讨SNHG3表达水平与胃癌患者的生存时间之间的关系。应用生物信息学手段分析SNHG3共表达基因影响的生物进程和信号通路。结果 IncRNA SNHG3在Ⅰ期胃癌(124.40±10.51,P=0.034)、Ⅱ期胃癌(128.10±9.88,P=0.003)、Ⅲ期胃癌(136.40±7.55,P=0.000)和Ⅳ期胃癌(125.10±13.34,P=0.004)中的表达水平均显著高于癌旁组织(67.16±8.19),并且SNHG3表达量高的胃癌患者的生存时间较短。生物信息学预测显示SNHG3广泛参与RNA剪接、电子呼吸链的传递、mRNA加工、细胞外基质组织、细胞黏附、骨架系统开发、胶原蛋白分解代谢过程、脂肪酸代谢、剪接复合物、癌症通路、磷酸肌醇3激酶(P13K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、RAP相关蛋白RAP-1A(Rap1)信号通路、Hippo信号通路等在内的多个生物学进程。结论 IncRNA SNHG3在胃癌组织中显著高表达,SNHG3表达量高的胃癌患者生存期短。

• 单位
  武汉大学中南医院; 荆州市中心医院