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摘要
目的 整合心脏病动物模型与心脏病患者基因表达谱，系统表征基因表达差异，筛选差异基因，分析基因表达异同，为动物实验与比较医学研究提供依据。方法 从公共数据库下载心脏病动物模型与患者的基因芯片、转录组数据。按照物种、病种、病程等对数据进行整理、标准化处理、批次校正，转换为数据库可用格式，搭建在线数据库。结果 心脏病动物模型比较转录组学数据库实现基因、功能通路全局检索查询，分析基因在不同物种(人与小鼠)、不同病种、不同组织、不同病程的表达。交互式展示样品表达谱，可视化基因表达量，进行比较分析。在线差异基因挖掘，功能通路富集鉴定，探索差异、易感基因参与调控的生物过程，解释易感机制，提供在线数据分析。结论 本文建立了心脏病动物模型比较转录组学数据库，为心脏病基因水平研究提供数据资源与在线分析工具。
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单位中国医学科学院医学实验动物研究所
