烟草NtGH3基因家族鉴定及其应答青枯菌侵染的表达分析

作者:徐沛雯; 余文; 程崖芝; 巫升鑫; 牛文利; 李冰洁; 王李先秋; 丁安明; 王卫锋
来源:分子植物育种, 2023, 1-14.

摘要

为研究植物酰胺合成酶(Gretchen Hagen 3, GH3)在青枯菌侵烟草过程中的作用,本研究对NtGH3基因家族进行了系统的生物信息学分析,并通过表达分析研究了其对青枯菌侵染的响应情况。结果表明,从烟草基因组数据库中共鉴定了25个GH3家族成员,命名为NtGH3.1~NtGH3.25,其编码蛋白包含的氨基酸残基个数为495~623,分子质量为55.17~69.80 kD,等电点位于5.14~6.93之间;大多NtGH3家族基因含有3~5个外显子和10个保守的氨基酸基序;系统进化分析表明,NtGH3基因家族分为I和II两个亚族;启动子分析结果显示,NtGH3启动子中含有多种激素及胁迫响应元件;表达分析结果表明,NtGH3基因家族成员在烟草根、茎、叶、种子和花芽五个组织部位的表达量存在较大差异,且其表达不同程度的受到青枯菌侵染的诱导,其中NtGH3.9和NtGH3.13被强烈诱导表达,可能在响应青枯菌侵染过程中发挥作用。本研究为进一步研究NtGH3基因在烟草响应青枯菌侵染中的作用提供了理论基础。

  • 单位
    安徽中烟工业有限责任公司; 中国农业科学院研究生院; 中国农业科学院烟草研究所