计算机辅助筛选酪氨酸激酶相关蛋白TRP-2 CTL模拟表位

作者：林治华; 王槐亮; 唐艳; 吴玉章

来源：Acta Chimica Sinica, 2007, (08): 760-764.

• 酪氨酸激酶相关蛋白
• 模拟表位
• 分子模拟

运用多项式方案、量化基序方案等经典的CTL表位筛选方案,初步筛选了酪氨酸激酶相关蛋白TRP-2 CTL表位TRP-2_(180～188)(SVYDFFVWL)的模拟表位,以通过表位改造提高其与HLA-A2.1分子结合的能力,从而提高其免疫原性,根据打分结果,合成了4个得分较高的九肽序列,亲和力实验结果表明所筛选的4个序列较原序列均有较高的亲和力,但对2位的单突变结果较1和2位双突变结果理想,进一步运用分子模拟方法对4个序列与HLA-A2.1分子间的相互作用进行了分子模拟分析,分子模拟结果较好地解释了上述实验现象,从而为进一步的结构改造提供了理论依据,本研究提供了一个合理高效的模拟表位筛选方法。

• 单位
  第三军医大学; 生物工程学院; 重庆理工大学