藏鸡基因组微卫星特征分析

作者:郭新颖; **; 李梦柔; 段梦琪; 严飞飞; 李雨晴; 王世伟; 强巴央宗; 商鹏*
来源:中国家禽, 2020, 42(01): 116-120.
DOI:10.16372/j.issn.1004-6364.2020.01.024

摘要

藏鸡为我国高原特有地方品种,为了保护其地方品种资源,开发高原特色产业,本研究采用MISA软件检测藏鸡全基因组序列中存在的微卫星位点,并找出其SSR开始分析。研究结果发现:共找到411 761个微卫星序列,含微卫星的序列共14 295条,微卫星平均每隔2 607.56 kb出现一个序列,其中1 055种重复基元模式在藏鸡DNA序列中被找到,所占比例份额最高的是(TA)n(47.49%),10~15 bp的是微卫星序列长度所在的主要区域。因此,藏鸡微卫星标记的开发利用为藏鸡品种的分子鉴定打下基础,可以加快藏鸡杂交选育进程,以便获得较好的开发前景和产生巨大的经济效益。