基于SSR标记的六种野生猕猴桃亲缘关系分析

作者：郭丽娜; 方玉梅; 韩世明; 陈志霞^*

来源：北方园艺, 2023, (20): 20-27.

• 猕猴桃
• 转录组
• SSR标记
• 遗传多样性
• 聚类分析

以贵州6种野生猕猴桃36个居群为试材，采用生物信息学方法，对“红阳”猕猴桃应答橘小实蝇侵害的转录组数据进行SSR位点搜索，开发EST-SSR引物后，研究了36个野生猕猴桃居群180份种质的遗传多样性与亲缘关系，以期为合理保护及开发利用野生猕猴桃资源提供参考依据。结果表明：“红阳”猕猴桃果实EST-SSR的分布频率为43.07%,6种重复类型的重复次数分布在5～24次，优势重复类型为二核苷酸，占总SSR位点的69.19%。参试的40对EST-SSR引物中有28对引物均可在6种野生猕猴桃中扩增出目的条带，在180个猕猴桃种质中共检测出了348个等位基因位点。多态性信息含量(PIC)在0.376 6(引物：P3-22)～0.930 4(引物：P4-37),平均为0.783 6,其中只有1对引物为中等多态性引物，其它均为高多态性引物。聚类分析显示，6种野生猕猴桃在遗传距离0.72处可分成2个类群，黄毛猕猴桃、毛花猕猴桃、阔叶猕猴桃被归为一类，京梨猕猴桃、异色猕猴桃、硬毛猕猴桃为一类。

• 单位
  六盘水师范学院