谷子MYB-CC基因家族的鉴定与表达分析

作者：李明明; 晋敏姗; 胡海斌; 王浩; 于港华; 邢国芳^*

来源：激光生物学报, 2021, 30(03): 259-269.

• 谷子
• MYB-CC基因家族
• 生物信息学
• 基因表达
• 低磷胁迫

MYB-CC基因家族是由MYB-DNA结合域和CC(coiled-coil)结构域组成的,其中CC结构域能通过折叠参与蛋白质之间的相互作用,是一个二聚体结构域。这类MYB-CC转录因子是植物特有的,除磷饥饿响应蛋白1(PHR1)外,拟南芥中另外14个蛋白也同样具有这两个结构域。部分MYB-CC基因已经被证明可调控植物中磷酸盐吸收和控制磷饥饿反应。为了探索谷子MYB-CC基因家族的特征和功能,本文通过生物信息学分析来解析谷子MYB-CC基因家族的特征,分析其表达模式及谷子与水稻、玉米基因组中的MYB-CC基因家族的共线性、选择压力。结果表明:通过基因在谷子染色体上的定位情况,共筛选到谷子MYB-CC基因家族基因18个,分布在7条染色体上;基序分析发现存在1个相对保守的基序motif 1;顺式作用元件分析发现,参与防御和胁迫响应相关的MYB-CC基因有6个;基因表达模式分析结果显示,SiMYB-CC6在根和茎秆中特异性表达。该研究结果可为谷子MYB-CC基因家族的进一步研究提供一定的参考依据。

• 单位
  山西农业大学