摘要
目的 基于网络药理学分析中药经典复方痛泻要方的活性成分、靶点和信号通路,并探索痛泻要方治疗结肠炎相关结肠直肠癌(CaCRC)的潜在分子机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获得痛泻要方的主要化合物及其靶点,利用Cytoscape3.8.2绘制痛泻要方“药物-活性成分-靶点”网络图。采用GeneCards数据库搜索与CaCRC疾病相关基因,对痛泻要方中药物对应的潜在靶点与CaCRC致病基因取共同部分,作为痛泻要方的预测靶点。采用DAVID数据库对痛泻要方治疗CaCRC的预测靶点进行基因本体(GO)功能富集、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。基于STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络图。利用中医药整合药理学研究平台V2.0(TCMIP V2.0)对作用于PPI网络中核心靶点的中药活性成分进行吸收、分配、代谢、排泄和毒性(ADMET)水平分析。通过Python脚本和AutoDock Vina软件将ADMET分析得到的吸收水平较好的活性化合物与PPI分析获得的关键靶点进行分子对接,并计算结合能。结果 项目收集到痛泻要方中4味中药的40个化学成分和145个靶标信息,并获得了3184个疾病靶标,将药物和疾病靶标取交集获得101个核心靶标,其中TP53、AKT1、CCND1等基因与CaCRC相关性较强。对核心靶标进行GO和KEGG分析结果显示,这些靶标主要富集于对无机物的反应、细胞对有机环状化合物的反应、MAPK级联激活过程和乙型肝炎、流体剪切力和动脉粥样硬化、前列腺癌等生物过程。PPI网络分析结果显示痛泻要方治疗CaCRC的关键靶点主要包括纤维连接蛋白1(FN1)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、CAMP反应元件结合蛋白1(CREB1)等。对痛泻要方中作用于关键靶点的活性成分进行ADMET分析,结果显示痛泻要方中的川皮苷、柚皮素、5-O-甲基维斯阿米醇等成分吸收水平较好。分子对接中川皮苷、柚皮素、汉黄芩素、地黄酚和5-O-甲基维斯阿米醇与FN1、RELA、CCND1、GSK3B、AR的结合能均小于≤-5.0 kJ/mol,展现出较好的亲和力。结论 痛泻要方中主要化学成分可能通过调节对无机物的反应、细胞对有机环状化合物的反应、MAPK级联激活过程等改善CaCRC。复方中主要活性成分川皮苷、柚皮素、汉黄芩素、地黄酚和5-O-甲基维斯阿米醇与关键靶点FN1、RELA、CCND1、GSK3B、AR结合可能是其发挥作用的重要机制。
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单位首都医科大学附属北京世纪坛医院