目的:利用ISSR标记技术对全国不同产地和表型的半夏居群进行了遗传多样性分析。方法:从80条引物中筛选出8个合适的引物进行半夏不同居群的ISSR分析。结果:8条ISSR引物共扩增出104条带。用SPSS15.0软件分析,建立了Jaccard相关系数矩阵,构建了遗传树系图,从图中可知35个半夏居群中表型先于产地聚类在一起。结论:ISSR标记适合于半夏的DNA遗传多样性分析;在半夏种质资源划分上产地较表型更为重要。