青海省2013年手足口病病原特征和人肠道病毒A组71型基因特征

作者:杨倩; 赵生仓; 檀晓娟; 张勇; 祝双利; 冀天娇; 范丽霞; 杨维雄; 刘桂香; 安洪秋; 许文波
来源:中国疫苗和免疫, 2015, 21(01): 41-45.
DOI:10.19914/j.cjvi.2015.01.009

摘要

目的对青海省2013年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)的病原谱和人肠道病毒A组71型(Human Enterovirus Group A Type 71,HEV_(A71))的基因特征进行分析。方法对青海省2013年送检的HFMD标本,用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法进行筛查,对HEV_(A71)阳性标本进行病毒分离,对分离到的病毒提取核酸,用RT-PCR方法对VP1编码区进行扩增及核苷酸序列测定和整理分析,并与HEV_(A71)各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果对青海省2013年分离的62株HEV_(A71)进行VP1编码区核苷酸序列测定后,分析发现它们在VP1编码区核苷酸水平和氨基酸水平的同源性分别为95.5%~100.0%和99.0%~100.0%。与其他各基因型和基因亚型的HEV_(A71)代表株构建的亲缘进化树中显示,青海省HEV_(A71)分离株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型C_(4a)进化分支。与2008年、2012年在青海省分离的HEV_(A71)在核苷酸和氨基酸水平的同源性分别为95.8%~97.5%和99.0%~99.7%。结论2013年,C_(4a)亚型HEV_(A71)在青海省持续传播并占有绝对优势,且存在两条传播链的流行。

  • 单位
    中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室; 青海省疾病预防控制中心

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