北红葡萄组织培养生根期愈伤组织的转录组分析

作者:韦伟; 单守明*; 李光宗; 许文娣
来源:甘肃农业大学学报, 2023, 58(04): 127-136.
DOI:10.13432/j.cnki.jgsau.2023.04.014

摘要

【目的】探究北红葡萄生根的分子机理,为北红葡萄繁育中生根提供理论和实践指导。【方法】将北红葡萄组织培养至生根期,筛选出较为适合生根的培养基类型后,正交试验设计以不同质量浓度IBA(0.1、0.3和0.5 mg/L)、NAA(0.1、0.3和0.5 mg/L)和蔗糖(15、25和35 g/L)进行处理,统计处理20 d后各处理的生根情况,并对基部生根愈伤组织进行转录组测序分析。【结果】1/2B5培养基较为适合北红葡萄生根。转录组测序的6个样本共获得的高质量序列共254.80 Gb,样品有88.13%~89.94%的序列可以比对到参考基因组上,DEGs以上调表达为主。对植物激素信号转导通路进行分析,有7个DEGs可能对其生根有重要作用,生长素途径中的14个DEGs上调表达。进行qRT-PCR验证,转录组数据可信,相关系数为0.89。【结论】转录组分析得到了在北红葡萄生根期中重要的通路和关键基因,为北红葡萄生根提供理论和实践指导。

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