牦牛源多杀性巴氏杆菌的分离鉴定及基因组功能分析

作者：王俊书; 徐进强; 封家旺; 顾庆云; 赵晓民^*; 金红岩^*

来源：动物医学进展, 2022, 43(06): 27-31.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2022.06.013

• 牦牛
• 多杀性巴氏杆菌
• 分离鉴定
• 基因注释

为了丰富西藏牦牛巴氏杆菌基因组相关研究数据，分析其潜在毒力因子基因和耐药基因，为下一步研究其致病机理提供遗传学支持数据。无菌采集病死牦牛的脾脏，分离培养1株细菌，经过VITEK2全自动微生物鉴定、16S rRNA比对和荚膜血清型PCR鉴定，确定分离菌株类型，经全基因组测序，对分离菌株进行VFDB、COG、CARD、KEGG数据库比对注释，确定基因的功能及相关描述信息。结果显示，Tbs20为A型多杀性巴氏杆菌，命名为Tbs20,分离菌株Tbs20基因组全长3 061 796 bp,基因数量2 852个，基因平均长度911.57 bp, C+G含量47.26%。非编码RNA 116个(4.07%),重复序列数151个(5.29%),确定了全基因组中的2 395个COG、2 127个KEGG基因和177个毒力因子，未发现耐药基因。结果表明，分离菌株Tbs20预测到的毒力因子和其他相关报道存在一定差异，且未检测到耐药基因的存在，与其他相关研究结果不同，这可能与西藏特殊的地理位置和极少使用抗菌药物有关。研究结果可为牦牛巴氏杆菌病的免疫和治疗提供参考依据。

• 单位
  西北农林科技大学; 西藏职业技术学院