西瓜种质资源背景选择标记筛选及遗传多样性分析

作者:栾非时; 闫令文; 刘树森; 刘钊; 高鹏; 宋正峰; 朱子成; 刘宏宇
来源:东北农业大学学报, 2021, 52(07): 19-32.
DOI:10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2021.07.003

摘要

利用在西瓜全基因组开发的446对SSR引物,筛选出一套覆盖西瓜11条染色体,分布均匀,多态性较高的110对引物,在此基础上分析81份西瓜种质资源遗传多样性。结果表明,检测到每对引物等位基因数变化为2~8个,平均3.4个,PIC值平均为0.4。聚类分析结果表明,将供试材料分为两大类群;通过全基因组关联分析检测到与果皮厚度显著相关SSR标记2个,分别位于4、9号染色体,与中心果肉可溶性固形物含量显著相关SSR标记2个,分别位于6、11号染色体,与种子厚度显著相关SSR标记1个,位于4号染色体。

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