银杏bHLH家族转录因子生物信息学及表达分析

作者：冯磊; 石元豹; 汪贵斌^*; 曹福亮

来源：江苏农业学报, 2019, 35(02): 400-411.

• 银杏
• bHLH转录因子
• 进化分析
• 表达分析

以银杏基因组数据为基础,对银杏bHLH转录因子进行筛选和分析,从银杏基因组中鉴定出72条bHLH转录因子。进一步分析发现,不同bHLH转录因子序列长度和分子量差异较大,而理论等电点及亲水性等比较接近;各家族成员均含有N端碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区;该家族可分为17个亚家族,相同亚家族成员保守基序的类型十分相似。通过启动子分析发现,多数银杏bHLH基因启动子均含有光响应元件、激素响应元件和逆境胁迫响应元件等。表达分析结果显示,有7条银杏bHLH基因的表达具有组织特异性,有6条基因在各组织中表达水平都比较高,预测其在银杏生物学过程中具有十分重要的作用。

• 单位
  南京林业大学; 南方现代林业协同创新中心