基于高通量分析泰山白首乌根际土壤细菌群落结构

作者：李洁; 王飞; 徐凌川^*

来源：广东农业科学, 2022, 49(05): 75-84.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2022.05.009

• 泰山白首乌
• 根际土壤
• 细菌
• 微生物群落
• 高通量测序技术

【目的】了解泰山白首乌根际土壤微生物群落结构和组成，为充分利用根际微生物资源，优选根际促生菌、提高仿野生种植技术提供理论依据及科学支撑。【方法】采用Illumina MiSeq高通量测序技术，分析测定3个产地2个根茎深度的泰山白首乌根际土壤细菌群落的丰富度和多样性。【结果】测序结果显示，6个泰山白首乌根际土壤样品共得到细菌5 404个OTUs，分属于22门63纲98目170科274属，其中样品LW20的优势菌门为酸杆菌门Acidobacteria，相对丰度为24.76%；样品LW10、LX10、LX20、CQ10、CQ20的优势菌门均为变形菌门Proteobacteria，相对丰度分别为57.89%、46.00%、38.22%、27.29%、31.05%；样品LW10的优势属为假单胞菌属Pseudomonas，相对丰度为22.35%；样品LW20的优势属为Spartobacteria-genera-incertae-sedis，相对丰度为21.37%；样品LX10的优势属为土壤红杆菌属Solirubrobacter，相对丰度为5.57%；样品LX20的优势属为鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas，相对丰度为4.31%；样品CQ10的优势属为norank-Acidobacteria-Gp4，相对丰度为9.58%；样品CQ20的优势属为Streptophyta，相对丰度为9.02%。【结论】综合比较，样品CQ10的细菌群落丰度和多样性最高，Chao和Ace指数分别为1 150.41和1 102.51；样品LX10的细菌群落分布最均匀，Shannoneven指数为0.8315；随着地下根茎深度加深，细菌微生物群落的丰度和多样性降低，不同产地和根茎深度样品间土壤细菌群落存在显著差异性。

• 单位
  山东中医药大学