基于铜死亡相关LncRNA的肝细胞癌预后预测模型构建及验证

作者：李京城; 张永芳; 胡婵; 刘玲; 彭倩; 桑圣刚^*; 曾江正

来源：山东医药, 2022, 62(31): 5-10.

DOI：10.3969/j.issn.1002-266X.2022.31.002

• 肝细胞癌
• 铜死亡相关基因
• 长链非编码RNA
• 预后预测模型

目的 基于铜死亡相关长链非编码RNA(LncRNA)建立肝细胞癌（HCC）预后预测模型，并进行效能验证。方法 从癌症基因图谱（TCGA）数据库获取肝细胞癌的RNA表达数据和临床数据，从文献中获取铜死亡相关基因集，相关性分析筛选铜死亡相关的LncRNA,Lasso回归和Cox回归筛选有临床预后意义的LncRNA并构建预后预测模型，通过生存分析、受试者工作特征曲线、校准曲线评估该模型的预测效能。结果 共纳入6个具有独立预后意义的LncRNA(PICSAR、AC026356.1、MKLN1-AS、AL928921.1、LINC00479、AC026412.3)，并成功构建预后预测模型。分别对整个数据集、测试集、训练集按高、低风险分组进行生存分析，结果表明，在3个数据集中高风险组的总生存期均短于低风险组，整个数据集中高风险组的无进展生存期短于低风险组（P均<0.05）；随着风险评分的增加，样本死亡的数量也在增加，在测试集与整个数据集中也验证了该结论。该风险模型预测1、3、5年生存率的曲线下面积分别为0.765、0.664、0.649；与TNM分期（0.667）、年龄（0.538）、性别（0.512）、分化程度（0.507）相比，风险评分模型的曲线下面积（0.765）最大。单因素和多因素Cox回归分析表明，TNM分期、风险评分是独立预后因素；绘制列线图，一致性指数为0.679(95%CI:0.652～0.705)，结合校准曲线，表明预测的生存率与实际观测到的生存率基本一致。结论 根据6个铜死亡相关LncRNA成功构建了HCC患者的预后预测模型，经验证该模型预测效能较高。

• 单位
  海南医学院第一附属医院