藜麦SOD家族基因的鉴定及混合盐碱胁迫下表达分析

作者：邓玉荣; 韩联; 王金龙; 韦兴翰; 王旭东; 赵颖; 魏小红^*; 李朝周^*

来源：中国农业科技导报, 2023, 1-12.

DOI：10.13304/j.nykjdb.2022.0558

• 藜麦
• SOD基因家族
• 盐碱胁迫
• 生物信息学分析
• 表达分析

超氧化物歧化酶（superoxide dismutase,SOD）是植物抗氧化系统的关键酶，在保护植物免受生物和非生物胁迫方面发挥重要作用。采用生物信息学方法，以拟南芥SOD为基础，通过序列比对在藜麦基因组中鉴定出12个SOD基因，分别定位于细胞核、微体及线粒体，在11条染色体上不均匀分布，其编码蛋白质三级结构显示Cu/Zn-SODs与Fe-SODs为同源二聚体，Mn-SODs为同源四聚体。CqSOD基因内含子/外显子分布模式不尽相同，内含子数介于4～7个，保守基序差异明显。系统发育关系显示，SOD蛋白可分为Cu/Zn-SODs、FeSODs及Mn-SODs 3大亚族。此外，所有的CqFe-SODs及CqMn-SODs启动子区都含有脱落酸激素反应顺式元件，CqSOD12与11个CqSOD蛋白及4个CqCAT蛋白存在相互作用。表达谱分析表明，12个CqSOD基因对混合盐碱及硝普钠均有较强响应。研究结果为SOD基因在植物发育和胁迫响应中的作用及分子机制研究奠定基础。

• 单位
  甘肃农业大学; 生命科学技术学院