利用转录组学分析三峡肽素生物合成的基因簇

作者:刘超; 李坤; 白晓轩; 杨宇纯; 薛艳红; 刘士平
来源:食品工业科技, 2021, 42(13): 156-162.
DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2020110192

摘要

为了分析三峡肽素(Sanxiapeptin)生物合成途径,本文采用BGISEQ-500平台测定了SG-4在200 mL培养4、7 d及300 mL培养7 d时c DNA文库,并对高通量测序产生的6.42 Gb序列数据进行了无参转录组分析。结果表明,转录组序列比对率高达93.88%,差异基因主要集中在抗生素合成、物质转运及氧化还原代谢等途径,在非核糖体肽合成酶(NRPS,Non-ribosomal peptide synthetase)基因簇PDE01071中,21个基因的表达趋势与物质的含量完全吻合,暗示其可能参与了三峡肽素的合成。

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