黄河学的分支学科应该从横向、纵向和立向来划分各分支;横向上按照学科属性划分为黄河自然科学和黄河人文科学;纵向上按照研究对象所处的时间划分为古黄河学、历史黄河学、现代黄河学和预测黄河学;立向上按照研究对象具体程度划分为黄河哲学、理论黄河学、应用黄河学和黄河地理学;三个方向的分支学科划分还应该进行体系的整合。