水稻‘宜香优2115’OsNramp5基因的克隆及生物信息学分析

作者：王建伟; 汤宏^*; 贺晓岚; 秦绍钊

来源：分子植物育种, 2022, 20(07): 2096-2104.

DOI：10.13271/j.mpb.020.002096

• 水稻(Oryza sativa L.)
• OsNramp5基因
• 克隆
• 生物信息学分析

天然抗性相关巨噬蛋白(natural resistance associated macrophage protein,Nramp)在调控植物吸收转运Fe2+、Mn2+、Zn2+和Cd2+等重金属离子方面具有重要作用，其成员OsNramp5基因在锰、铁及镉的吸收和转运过程中扮演重要角色。本研究根据水稻OsNramp5 (AB690551.1)，同源克隆了富铁锌低镉水稻‘宜香优2115’OsNramp5基因的cDNA全长序列，命名为OsNramp5-YXY2115，并对其序列进行生物信息学分析。研究结果表明，其开放阅读框为1 617 bp，编码538个氨基酸，蛋白序列含有12个跨膜结构，分子量约为58.5 kD，理论等电点为6.76。功能结构域分析结果证实，Os Nramp5-YXY2115蛋白包含有Nramp金属离子转运结构域MntH，属于Nramp超家族成员。多序列比对及进化树分析结果表明该序列与NCBI中公布的粳稻Os Nramp5(XP＿015645014)氨基酸序列相似性最高，为100%，推测OsNramp5-YXY2115基因可能参与响应Fe2+、Mn2+、Zn2+和Cd2+等重金属胁迫。本研究结果为进一步研究OsNramp5-YXY2115的生物学功能提供了基础资料，也为植物重金属研究提供了重要候选基因。

• 单位
  凯里学院