广西首例HIV-1G亚型毒株的发现和近似全长基因组序列分析

作者：李天一; 梁淑家; 陈立力; 刘伟; 李敬云; 李林

来源：军事医学, 2012, (03): 192-195.

• G亚型
• HIV-1
• 近似全长序列
• 系统进化树分析
• 基因组 G-subtype
• near full-length sequence
• phylogenetic tree analysis
• genome

目的获得广西首例HIV-1 G亚型毒株全长基因组序列并分析其来源。方法采集1例广西HIV感染者血浆,提取病毒RNA,利用逆转录巢式-PCR技术,分两段扩增病毒近似全长基因序列,对PCR产物进行核苷酸序列测定,利用MEGA软件对全长序列进行系统进化分析。结果获得了8800 bp长度的近似全长基因组序列,系统发育分析结果显示该毒株与HV-1 G亚型参考株成簇,Bootstrap值为99%,通过与世界上其他地区流行的HIV-1 G亚型毒株进行亲缘分析,该毒株与喀麦隆流行毒株的关系最近。结论在广西发现了首例HIV-1 G亚型感染者,推测该毒株是由境外传入的,应对广西地区流行的HIV-1毒株的来源和变异...

• 单位
  军事医学科学院; 病原微生物生物安全国家重点实验室; 兰州军区乌鲁木齐总医院; 广西壮族自治区疾病预防控制中心